lnu.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
On Open Problems in Biological Network Visualization
Växjö universitet, Fakulteten för matematik/naturvetenskap/teknik, Matematiska och systemtekniska institutionen. (ISOVIS)ORCID-id: 0000-0002-0519-2537
Visa övriga samt affilieringar
2009 (Engelska)Ingår i: Graph Drawing: 17th International Symposium, GD 2009, Chicago, IL, USA, September 22-25, 2009. Revised Papers / [ed] David Eppstein and Emden R. Gansner, Berlin Heidelberg New York: Springer, 2009, s. 256-267Kapitel i bok, del av antologi (Refereegranskat)
Abstract [en]

Much of the data generated and analyzed in the life sciences can be interpreted and represented by networks or graphs. Network analysis and visualization methods help in investigating them, and many universal as well as special-purpose tools and libraries are available for this task. However, the two fields of graph drawing and network biology are still largely disconnected. Hence, visualization of biological networks does typically not apply state-of-the-art graph drawing techniques, and graph drawing tools do not respect the drawing conventions of the life science community.

In this paper, we analyze some of the major problems arising in biological network visualization.We characterize these problems and formulate a series of open graph drawing problems. These use cases illustrate the need for efficient algorithms to present, explore, evaluate, and compare biological network data. For each use case, problems are discussed and possible solutions suggested.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Berlin Heidelberg New York: Springer, 2009. s. 256-267
Serie
LNCS, ISSN 0302-9743 ; 5849
Nyckelord [en]
Network Visualization, Graph Drawing, Biochemical Networks, Challenges
Nationell ämneskategori
Datavetenskap (datalogi)
Forskningsämne
Data- och informationsvetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:vxu:diva-5661DOI: 10.1007/978-3-642-11805-0_25ISBN: 978-3-642-11804-3 (tryckt)OAI: oai:DiVA.org:vxu-5661DiVA, id: diva2:228801
Konferens
the 17th International Symposium on Graph Drawing (GD '09)
Tillgänglig från: 2009-08-06 Skapad: 2009-08-06 Senast uppdaterad: 2018-01-13Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Kerren, Andreas

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Kerren, Andreas
Av organisationen
Matematiska och systemtekniska institutionen
Datavetenskap (datalogi)

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
isbn
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
isbn
urn-nbn
Totalt: 346 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf