Påverkar bakterien Rheinheimera BAL341:s odlingsmedium infektion av fagen Barba18A?: Undersökning med plackanalys och bakterielysering i flytande medium
2023 (Swedish)Independent thesis Basic level (degree of Bachelor), 10 credits / 15 HE credits
Student thesis
Abstract [sv]
Inom marinekologi är en relevant fag-bakteriemodell stammen Rheinheimera BAL341 och dess fag Barba18A från Östersjön. Tidigt i ett virus lytiska infektionscykel binder viruset till en specifik ytstruktur på bakterien för att därefter föra in genetiskt material. När bakterier adapterar till sin miljö kan strukturer som är viktiga för virusinfektion förändras och därmed påverka infektionsförmågan. En vanligt förekommande kvantifieringsmetod inom virologi är plackanalys där antalet plack räknas i en bakteriematta. Bakterielysering i flytande medium är en metod som bygger på kontinuerlig mätning av optisk densitet (OD) i en bakteriekultur vid tillsättning av ett virus. Syftet med arbetet är att undersöka om infektionsförmågan hos Barba18A varierar beroende på näringssammansättning i mediet som Rheinheimera BAL341 odlas i. Odlingsmedium berikade med näring från Prymnesium parvum, Dolichospermum lemmermannii eller Nodularia spumigena kombinerat med glukos respektive pepton användes. Metoderna som användes var plackanalys och bakterielysering i flytande medium. Skillnaden i infektionsgrad från plackanalys mellan olika medier testades statistiskt med Kruskal-Wallis test (α:0,05) varpå ingen signifikant skillnad (p>0,05) erhölls. Rheinheimera BAL341 i medier med olika näringssammansättning med Barba18A gav ingen skillnad i lysering. Kulturen i näringskombinationen algmedium och glukos med Barba18A hade lägre OD genom nästintill hela odlingen vilket tros bero på att OD var lågt redan vid start. Slutsatsen som dras är att variationen i näring i medierna som Rheinheimera BAL341 odlades i inte påverkat infektionsförmågan hos Barba18A.
Abstract [en]
Rheinheimera BAL341 and its phage Barba18A from the Baltic Sea is an ecologically relevant bacteria-phage model in marine environments. Plaque assay is a reference method in virology used to quantify infectious viral particles by counting the number of plaques in a lawn of bacteria. The growth curve crash method relies on traditional measuring of bacterial cultures through optical density (OD) and the fact that lytic phages lyse their host cell. Phages bind to specific surface structures in the attachment phase early in the lytic viral cycle. Since bacteria adapt to their surroundings and change structures in their outer membrane, it may affect the phage's ability to infect the bacterial cell. This study aims to investigate if the infection of Rheinheimera BAL341 by Barba18A varies if Rheinheimera grows in different media combinations. Media from three different algae cultures, Prymnesium parvum, Dolichospermum lemmermannii and Nodularia spumigena, combined with either glucose or peptone were used. The methods used were plaque assay and growth curve crash. The plaque assay results were statistically tested with the Kruskal-Wallis test (α:0,05) which resulted in no significant difference (p>0,05) between the different media combinations. Further, no direct difference was identified for cultures inbetween the different media combinations in the growth curve crash experiments. The culture in algae media combined with glucose and Barba18A showed low OD throughout almost the whole experiment, although it probably was due to having a low OD-value even before Barba18A was added. In conclusion, the different media combinations did not affect the infectivity of Rheinheimera BAL341 by Barba18A.
Place, publisher, year, edition, pages
2023. , p. 20
Keywords [en]
Marine microbiology, Barbavirus, Rheinheimera, plaque assay, growth curve crash
Keywords [sv]
Marin mikrobiologi, Barbavirus, Rheinheimera, plackanalys, bakterielysering i flytande medium
National Category
Microbiology
Identifiers
URN: urn:nbn:se:lnu:diva-121873OAI: oai:DiVA.org:lnu-121873DiVA, id: diva2:1768009
Subject / course
Biomedical Laboratory Science
Educational program
Biomedical Laboratory Science Programme, 180 credits
Supervisors
Examiners
2023-06-152023-06-142023-06-15Bibliographically approved