Metodjämförelse av snabbmetoder för resistensbestämning från blododling: QuickMIC®, RAST samt in-house-metod från Region Kalmar län
2024 (Swedish)Independent thesis Basic level (degree of Bachelor), 10 credits / 15 HE credits
Student thesis
Abstract [sv]
Sepsis är ett farligt tillstånd där en okontrollerad immunrespons uppstår efter att bakterier har nått blodomloppet och kan leda till septisk chock. Behandlingen innebär att hantera symtomen och ge antibiotika. Behandlingen av sepsis rekommenderas att påbörjas inom 60 minuter efter diagnos, vanligtvis med bredspektrumantibiotika. Med den ökande problematiken med antibiotikaresistens ökar risken för att den första behandlingen inte fungerar. För att fastställa den mest lämpliga behandlingen krävs tester utförda av kliniska mikrobiologilaboratorier. Metoder som buljongspädning (BMD) och diskdiffusions-metoden (DDM) används rutinmässigt men de är tidskrävande. Det finns därför en ökad efterfrågan på snabbare metoder. Syftet med studien var att jämföra QuickMIC® från Gradientech med Rapid antibiotic susceptibility testing (RAST) från The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) och en in-house-metod från Klinisk mikrobiologi i Region Kalmar Län (RKL). Totalt analyserades 32 blododlingar som innehöll gramnegativa bakterier, och resultaten jämfördes med BMD (15 isolat) och DDM. Jämförelsen mellan BMD och QuickMIC visade en essential agreement (EA) på 95%) och en categorical agreement (CA) på 97%, för BMD och in-house-metoden var EA på 89% och CA på 100%. CA mellan RAST och BMD bestämdes till 89%. Jämfört med DDM var CA 98% med QuickMIC®, 100% med in-house-metoden och 89% med RAST. In-house-metoden är en effektiv lösning för de behov som uppstår i RKL. Den är kostnadseffektiv och praktisk samtidigt som den visar en stark överensstämmelse med referensmetoder som BMD och DDM. Därför överväger fördelarna för den befintliga in-house-metoden, särskilt med tanke på Sveriges låga förekomst av mycket resistenta gramnegativa bakterier.
Abstract [en]
Sepsis, a dangerous condition triggered by an uncontrolled immune response to bacteria invading the bloodstream, can lead to septic shock. Treatment involves prompt symptom management and antibiotic administration, ideally within 60 minutes of diagnosis, normally by using broad-spectrum antibiotics. However, escalating antibiotic resistance poses a challenge, risking treatment failure. Clinical microbiology laboratories play a crucial role in determining the most effective treatment through tests, traditionally performed using methods like broth microdilution (BMD) and disk diffusion (DDM). However, these methods are time-consuming. Therefore, there is an increasing demand for faster methods. This study aimed to compare Gradientech's QuickMIC® with The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST)'s Rapid Antibiotic Susceptibility Testing (RAST) and an in-house method from Region Kalmar County (RKL). Analyzing 32 blood cultures with gram negative bacteria, we compared results obtained with BMD (15 isolates) and DDM. Agreement between BMD and QuickMIC® reached 95% for essential agreement (EA) and 97% for categorical agreement (CA), while BMD and the in-house method achieved 89% EA and 100% CA. Agreement between BMD and RAST was 89%. Compared to DDM, QuickMIC® showed 98% agreement, the in-house method 100%, and RAST 89%. The in-house method is an effective solution for the needs in RKL. It is cost-effective and practical while showing strong agreement with reference methods such as BMD and DDM. Therefore, the benefits indicate the continuation of the use of the in-house method, especially considering Sweden's low incidence of highly resistant gram-negative bacteria.
Place, publisher, year, edition, pages
2024. , p. 27
National Category
Biomedical Laboratory Science/Technology
Identifiers
URN: urn:nbn:se:lnu:diva-130975OAI: oai:DiVA.org:lnu-130975DiVA, id: diva2:1876991
Subject / course
Biomedical Laboratory Science
Educational program
Biomedical Laboratory Science Programme, 180 credits
Presentation
2024-05-28, 11:20 (Swedish)
Examiners
2024-06-252024-06-252024-06-25Bibliographically approved